La respiración bucal excesiva es especialmente preocupante en los recién nacidos, quienes pueden respirar hasta 40 veces por minuto. Por lo tanto, existe el riesgo de infección de las vías respiratorias, que supera las barreras inmunitarias, es decir, la colonización de bacterias, virus u hongos patógenos. La congestión nasal en un recién nacido complica considerablemente, e incluso a veces interfiere, el proceso de succión.

La respiración bucal constante puede provocar trastornos del desarrollo craneoencefálico, como la reducción de la mandíbula inferior y otras malformaciones. Los niños que respiran por la boca presentan: labios estrechos, caras alargadas, paladar ojival y telangiectasias, que posteriormente pueden asociarse con un habla incorrecta.

Se ha observado que los niños que respiran por la boca a menudo presentan un aumento de tamaño de las amígdalas e inflamación recurrente del oído medio como reacción a la sequedad constante de las membranas mucosas. Un niño que respira por la boca suele tener una mala postura: la cabeza está inclinada hacia adelante, el pecho caído y la espalda redondeada. Estos cambios están asociados con el colapso de la lengua y la búsqueda refleja de un mejor flujo de aire en las vías respiratorias.